Ganadería extensiva y muestreos ambientales: hacia el futuro de la sanidad animal.

Marta Pérez-Sancho¹, Ángela Marín², Alberto Díez-Guerrier³, Carmen Herranz⁴, Patricia Barroso⁵, Alberto Perelló², Ana Balseiro⁶, Teresa Garcia-Seco⁴, Andrea Serrano-Hernando⁷, Lucas Domínguez⁸, Christian Gortázar²

(1)-Centro VISAVET, Universidad Complutense de Madrid; Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria, Universidad Complutense de Madrid, Madrid, 28040, España. (2)-SaBio Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos (IREC) CSIC-UCLM-JCCM (3)-MAEVA-SERVET SL y Universidad Complutense de Madrid
(4)-Centro VISAVET, Universidad Complutense de Madrid (5)-Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria, Universidad de León (6)-Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria, Universidad de León; Instituto de Ganadería de Montaña (IGM, CSIC-ULE)
(7)-MAEVA-SERVET SL (8)-Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria y Centro VISAVET, Universidad Complutense de Madrid

La producción bovina en
régimen extensivo es una práctica ganadera con incuestionables beneficios socioeconómicos,
de bienestar animal y para la conservación de la biodiversidad. Sin embargo, conlleva
también cierta preocupación en cuanto a la bioseguridad, por ejemplo, derivada
del potencial contacto con la fauna silvestre y el riesgo de transmisión de
patógenos. La implementación de programas de bioseguridad para la mitigación o
reducción de riesgos (PMRs) ha demostrado ser una estrategia eficaz en el
interfaz ganado doméstico-animales silvestres. La existencia de herramientas
que permitieran valorar el impacto de PMRs en la circulación de patógenos en
este interfaz supondría un gran avance en la optimización de programas de
bioseguridad en estos sistemas ganaderos. Nuestro grupo ha implementado con
éxito un sistema de muestreo ambiental mediante esponjas que permite la
monitorización de DNA ambiental (eDNA) para la detección de patógenos como
miembros del Complejo Mycobacterium tuberculosis, Brucella suis o
Coxiella burnetii. El objetivo de este trabajo es valorar si esta
estrategia de detección molecular de patógenos mediante muestreos no invasivos
permite valorar el impacto de PMRs en la circulación de patógenos en
explotaciones de ganado bovino en régimen extensivo.

Para ello, este trabajo
plantea la implementación de esta herramienta para la monitorización de tres
marcadores genéticos de patógenos (IS6110 para Mycobacterium tuberculosis
complex, uidA para Escherichia coli e invA para Salmonella
enterica) mediante PCR en tiempo real en dos puntos temporales:  antes y después de la implementación PMRs (que
incluía un amplio rango de modificaciones y adaptaciones de puntos de agua y
comederos, así como cambios en la rotación y uso de pastos y en la gestión de
la caza) en seis explotaciones de ganado bovino en extensivo.

En el primer muestreo
(previo a la intervención), se detectaron 4, 58 y 13 muestras positivas a IS6110,
uidA y invA, respectivamente, en las 119 muestras
ambientales recogidas. El segundo muestreo puso de manifiesto la existencia de
12, 78 y 1 positivos en 174 muestras ambientales recolectadas en esta etapa.
Esto se tradujo una reducción del 8% para el marcador uidA y del 95%
para invA (p<0.001). Por el contrario, el marcador IS6110 solo
se detectó en menor proporción en 1 de las 6 explotaciones, mientras que en 3
de ellas se detectó en mayor número de muestras.

El impacto aparente de los
PMRs en la detección de marcadores de patógenos fue muy variable, ya que un
marcador aumentó mientras que los otros dos disminuyeron. El aumento registrado
podría asociarse con un incremento en la circulación del patógeno o con algunas
modificaciones implementadas en el laboratorio en el procesado de las muestras
ambientales durante el segundo muestreo.

En cualquier caso, la
técnica de muestreo ambiental ha demostrado ser una alternativa a los muestreos
tradicionales (invasivos, sobre el animal) viable para la evaluación del
impacto aparente de los PMRs en la bioseguridad de este tipo de explotaciones.
Estos hallazgos abren una línea de investigación para explorar su utilidad en
otras intervenciones en la interfaz del ganado-fauna silvestre, para otras
especies animales, sistemas de cría y patógenos de interés.